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运城职业技术学院有机食品工程系，2008年正式获准成为山西省唯一的国际有机农业运动联盟（IFOAM）成员，是中国第一家有机食品学历教育的专业学院。2009年正式列入国家高校统招计划，现已开设三个专业：有机食品生产技术专业、有机食品生产与检验技术专业和有机食品加工技术专业。学院以教学为主，同时集科研、咨询、培训、社会服务于一体。

为了提高学生的专业实践技能，有机食品科技学院已与台湾、上海、北京及运城当地的兄弟院校、企事业单位开展了密切的合作，聘请相关的专业技能人员来校兼职、讲学等，指导学生的实验实践课程。

据2007年美国劳工局和加拿大人力资源部统计，未来工作前景最为看好的十大专业中，有机食品专业居第三名（新媒体、生物工程专业分列第一、二名）。从2006年起，美国政府要求大学开设有机农业课程。同时，日本贸易振兴会官员认为，有机食品是今后中国向日本出口的最有前途、最有开发价值的产品。中国有机食品产业有着巨大的国际市场和潜在的国内市场。2013年中国大陆只有运城职业技术学院有机食品科技学院从事有机食品专业人才培养的学历教育。

有机食品专业的设置，对于培养有机食品方面的专业型人才，满足社会和有机食品产业发展的需要，具有重要意义。对于中国第一个有机食品专业，院领导特别重视，将有机食品专业建设作为运城职业技术学院大专部的重点工作。

汽车工程系组建于2008年7月，是运城职业技术学院成立较早、规模较大的学院之一，也是运城职业技术学院重点建设的二级学院。汽车工程学院以高职教育为主，同时还设有中职教育和非学历职业培训教育。学院大专部现下设汽车技术服务与营销、汽车检测与维修两个专业。其中汽车检测与维修专业为运城职业技术学院人才培养模式创新的试验点。

拥有实践经验丰富、年富力强的学科带头人和一支结构合理、实力雄厚的“双师型”教师队伍。学院以“实践瞄准实战、教师也是教练”的师资队伍建设为重点，组建和培养既能上讲台讲课又能下车间干活，既懂得如何教学又懂得如何训练，既是训练的设计者又是学生实际操作的指导者的“教练型”教师。2012年本专业有专业教师15名，其中专职9人，兼职6人，高级职称5人，研究生学历3人，本科生7人，技师5人。汽车工程学院院长王小晋高级工程师，是山西省汽车维修行业协会首席专家，其他多名教师接受过美国、德国、日本等汽车大国的汽车制造商的技术培训和学习。

汽车工程系教学、实验实训室及实训车间建筑面积达20000平方米，教学设施设备价值2000余万元。学院汽车实训中心为校内实验实训基地，拥有8000平方米的教学厂房，一个实训车间，150余套专业设备，可以满足学生实习实训的要求。